Un peu d'R

mercredi, septembre 17 2008

Deux trucs utiles pour Sweave

Par david le mercredi, septembre 17 2008, 15:39 - reporting

`keep.source=T`

Lorsqu'on utilise Sweave pour générer un rapport de résultats, les commentaires (commençant par #) inclus au milieu de commandes R sont par défaut supprimés.

Pour les conserver dans le document final, il faut :

soit localement, mettre l'option keep.source=T dans la balise introduisant les commandes R du fichier .Rnw :

<<echo=T,keep.source=T>>=
# Un petit commentaire
2+2
@

soit globalement, mettre l'argument keep.source=T dans la fonction Sweave() :

Sweave("mondocument.Rnw", keep.source=T)

`split=T`

Le fichier .tex générer par Sweave peut être assez compliqué à relire du fait de tous les résultats et tableaux générés par R. L'option split=T :

Sweave("mondocument.Rnw", split=T)

permet de créer un fichier principal, et plusieurs fichiers .tex contenant chacun un résultat. Ces fichiers sont automatiquement inclus dans le document principal par des commandes \input, rendant le tout plus lisible.

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vendredi, septembre 12 2008

Etaler un tableau de contingence

Par david le vendredi, septembre 12 2008, 10:23 - data management

Un tableau de contingence s'obtient avec la fonction table().

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vendredi, septembre 5 2008

Attribuer à chaque sujet la valeur moyenne d'une variable numérique selon le niveau d'un ou plusieurs facteurs

Par david le vendredi, septembre 5 2008, 11:57 - data management

Décidément, le plus dur, c'est de trouver un titre...

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Représenter l'incertitude avec des dégradés

Par david le vendredi, septembre 5 2008, 11:30 - graphiques

Un court billet pour vous parler d'un nouveau paquet disponible sur le CRAN : denstrip.

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vendredi, août 29 2008

Mise à jour vers Dotclear 2.0.1

Par david le vendredi, août 29 2008, 18:03 - nouvelles

sans intérêt

Je viens de mettre à jour le blog de Dotclear 2.0.0 vers Dotclear 2.0.1 en suivant cette procédure.

Alors, OK, la mise à jour n'est pas automatique, mais quand même c'est super simple !

Dotclear, c'est français, c'est libre, et c'est de la balle !

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lundi, août 25 2008

Sortie de R 2.7.2

Par david le lundi, août 25 2008, 14:08 - nouvelles

Nouvelles fonctionnalités (essentiellement) :

sprintf() retourne les éléments du résultat en UTF-8 quand le format ou un des caractères d'entrée est déclaré en UTF-8; De même pour paste(), les éléments du résultat sont en UTF-8 si un des éléments d'entrée est déclaré en UTF-8.
axis() a deux nouveaux arguments, 'col.ticks' et 'lwd.ticks', afin de paramétrer la couleur et l'épaisseur des marques indépendemment de celles de la ligne (i.e. de paramétrer l'une ou l'autre transparente ou d'épaisseur nul).
legend() a un nouvel argument 'box.col' pour paramétrer la couleur de la boite de contour.
legend() acquière un argument 'xpd' pour rendre plus facile le placement de la légende dans les marges ou à l'extérieur des marges.

La liste complète des modifications est disponible sur cette page.

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dimanche, août 24 2008

Créer et exécuter un appel de fonction à partir de son nom et d'une liste d'arguments

Par david le dimanche, août 24 2008, 18:24 - programmation

On peut construire dynamiquement l'appel d'une fonction à partir d'une chaine de caractères et d'une liste d'arguments.

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mardi, août 19 2008

Utiliser les arguments passer dans ...

Par david le mardi, août 19 2008, 18:00 - programmation

Lorsqu'on regarde l'aide de certaines fonctions, on se retrouve souvent devant un mystérieux argument : ...

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mercredi, août 13 2008

Régression linéaire par morceaux

Par david le mercredi, août 13 2008, 12:36 - modélisation

Voici un exemple de données :

xx <- 1:100 
yy <- 2 + 1.5*pmax(xx-35,0) + 0.5*pmax(35-xx,0) + rnorm(100, 0, 2) 
plot(xx, yy)

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lundi, août 4 2008

Combiner deux facteurs

Par david le lundi, août 4 2008, 13:24 - data management

Quand on a deux (ou plus) variables catégorielles, il est souvent utile de créer une variable correspondant aux différentes combinaisons existantes.

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vendredi, août 1 2008

Les différentes boucles

Par david le vendredi, août 1 2008, 10:10 - programmation

Pour réaliser des boucles, on peut utiliser 4 types de structures : for, while, apply (et ses dérivés) et repeat.

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Echelonner les labels des axes

Par david le vendredi, août 1 2008, 10:03 - graphiques

Désolé pour le terme "echelonner", mais je n'en ai pas trouvé d'autre sur le moment...

Le problème est d'empêcher les labels des axes de se superposer quand ils sont trop longs.

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mercredi, juillet 30 2008

Recoder une variable continue en catégories dont une qui ne contient qu'une seule valeur

Par vincent le mercredi, juillet 30 2008, 09:56 - data management

Bon, désolé pour le titre un peu long mais ça veut dire ce que ça veut dire....

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dimanche, juillet 27 2008

Ecrire correctement la formule d'un modèle

Par david le dimanche, juillet 27 2008, 12:12 - modélisation

La modélisation dans R nécessite de spécifier une formule. Les formules sont une classe à part entière dans R :

> class(y ~ x1*x2)
[1] "formula"

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Transformer une expression en une chaine de caractères

Par david le dimanche, juillet 27 2008, 10:14 - programmation

C'est l'opération de ce message, mais à l'envers.

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Interpréter une chaine de caractères comme une expression ou une commande

Par david le dimanche, juillet 27 2008, 10:12 - programmation

Rien de plus simple, et souvent indispensable quand on programme une fonction.

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Séparer une variable en fonction d'un facteur

Par david le dimanche, juillet 27 2008, 10:00 - data management

Il peut être bien pratique de séparer une variable en fonction d'un facteur.

Voici un exemple avec :

> x <- sample(0:2, 20, T) # Un facteur comportant 3 catégories 
> y <- rnorm(20) # Une variable numérique quelconque

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Un peu d'R

Deux trucs utiles pour Sweave

`keep.source=T`

`split=T`

Etaler un tableau de contingence

Attribuer à chaque sujet la valeur moyenne d'une variable numérique selon le niveau d'un ou plusieurs facteurs

Représenter l'incertitude avec des dégradés

Mise à jour vers Dotclear 2.0.1

Sortie de R 2.7.2

Créer et exécuter un appel de fonction à partir de son nom et d'une liste d'arguments

Utiliser les arguments passer dans ...

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Combiner deux facteurs

Les différentes boucles

Echelonner les labels des axes

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Ecrire correctement la formule d'un modèle

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Interpréter une chaine de caractères comme une expression ou une commande

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